Od prvního případu onemocnění koronavirem v prosinci 2019 se pandemická nemoc rozšířila na miliony lidí po celém světě.Tato celosvětová pandemie románutěžký akutní respirační syndrom koronavirus 2 (SARS-CoV-2)je jednou z nejpřesvědčivějších a nejpůsobivějších globálních zdravotních krizí moderní doby, která představuje velkou hrozbu pro svět a ovlivňuje všechny aspekty lidského života.[1]
Koronaviry jsou obalené jednovláknové RNA viry s pozitivním smyslem z čeledi Coronaviridae, které mají široké spektrum hostitelů, jako jsou lidé, netopýři, velbloudi a ptačí druhy, včetně hospodářských zvířat a společenských zvířat, což představuje hrozbu pro veřejné zdraví. 1 Koronaviry jsou klasifikovány v podčeledi Orthocoronavirinae, která se dále dělí do čtyř rodů na základě rozdílů v proteinových sekvencích: a-koronavirus, b-koronavirus, g-koronavirus a d-koronavirus.a-koronaviry a b-koronaviry infikují pouze savce, zatímco g-koronaviry a d-koronaviry primárně infikují ptáky, i když některé z nich mohou infikovat savce.HCoV-229E,
oV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV, MERS-CoV a SARS-CoV-2 je sedm koronavirů, u kterých bylo zjištěno, že infikují lidi.Mezi nimi SARSCoV a MERS-CoV, které se objevily v lidské populaci v letech 2002 a 2012, jsou vysoce patogenní.Zatímco kmeny lidského koronaviru (HCoV)-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 nebo HCoV-HKU1 cirkulující v lidské populaci způsobují pouze běžné nachlazení,7 koronavirus těžkého akutního respiračního syndromu 2 (SARS-CoV2), původce onemocnění COVID-19 je nový b-koronavirus, který se brzy objevil na konci roku 2019 a měl za následek zničující úmrtí.Primární příznakyCOVID 19jsou podobné jako u SARS-CoV a MERS-CoV: horečka, únava, suchý kašel, bolest v horní části hrudníku, někdy průjem a dušnost.Na rozdíl od minulostiinfekce koronavirem (CoV).Rychlé globální šíření, vysoká míra přenosu, delší inkubační doba, více asymptomatických infekcí a závažnost onemocnění SARS-CoV-2 vyžadují důkladné znalosti o strategiích virového imunitního úniku.
Stejně jako ostatní lidské koronaviry (SARS-CoV-2, MERS-CoV) má SARSCoV-2 také jednovláknový genom RNA s pozitivním smyslem o velikosti přibližně 30 kb.Jak je znázorněno na obrázku 1, virové nukleokapsidové (N) proteiny svazují genom do velkého ribonukleoproteinového (RNP) komplexu, který je pak obalený lipidy a virovými proteiny S (hrot), M (membrána) a E (obal).50. konec genomu má dva velké otevřené čtecí rámce (ORF), ORF1a a ORF1b, kódující polypeptidy pp1a a pp1b, které jsou produkovány do 16 nestrukturálních proteinů (NSP) zahrnujících každý aspekt virové replikace virovými proteázami NSP3 a NSP5, které obsahují proteázovou doménu podobnou papainu a proteázovou doménu podobnou 3C.9 30. konec genomu kóduje strukturální proteiny a doplňkové proteiny, z nichž ORF3a, ORF6, ORF7a a ORF7b se ukázaly jako virové strukturální proteiny. při tvorbě virových částic a ORF3b a ORF6 fungují jako antagonisté interferonu.Podle současné anotace na základě sekvenční podobnosti s jinými b-koronaviry zahrnuje SARS-CoV-2 predikce šesti doplňkových proteinů (3a, 6, 7a, 7b, 8 a 10).Ne všechny tyto ORF však byly dosud experimentálně ověřeny a přesný počet doplňkových genů SARS-CoV-2 je stále předmětem sporu.Proto stále není jasné, které přídatné geny jsou ve skutečnosti exprimovány tímto kompaktním genomem.[2]
Vysoce citlivé a specifické testy jsou klíčové pro identifikaci a léčbu pacientů s COVID-19 a také pro zavedení kontrolních opatření k omezení propuknutí.Molekulární testy POC (point-of-care) mají potenciál umožnit dřívější detekci a2 izolaci potvrzených případů SARS-CoV-2 ve srovnání s laboratorními diagnostickými metodami, a tím snížit přenos v domácnostech a komunitách.
[1]Klinický a provozní dopad rychlé detekce SARS-CoV-2 v místě péče na pohotovostním oddělení
[2] Bitva mezi hostitelem a SARS-CoV-2: Vrozená imunita a strategie vyhýbání se virům
Čas odeslání: 25. května 2022